Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP1Q9BPW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms