Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms