Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2BQ99453 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms