Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCF12Q99081 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms