Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms