Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms