Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC7Q96NW7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms