Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms