Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms