Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms