Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms