Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC74BQ96LY2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC74BQ96LY2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms