Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC17Q96LX7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms