Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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SAMD8Q96LT4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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