Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms