Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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