Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms