Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms