Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms