Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms