Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMTQ93088 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMTQ93088 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms