Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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