Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms