Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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