Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE23Q8NDY6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms