Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACBD4Q8NC06 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms