Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KBTBD3Q8NAB2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms