Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms