Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SV2BQ7L1I2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.1 ms