Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNDC1Q76NI1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms