Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS12Q6ZW61 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms