Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms