Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms