Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms