Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L3Q6VB84 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms