Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG3Q6UXM1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms