Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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