Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC171Q6TFL3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms