Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms