Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWSAP1Q6NVH7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms