Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms