Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms