Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms