Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF38BQ5VTL8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms