Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP350Q5VT06 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms