Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PAPPA-AS1Q5QFB9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms