Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRMS1LQ5PSV4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms