Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms