Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms