Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms